中国围棋协会随后发布声明,表示不接受第三局比赛结果。声明称:“在1月23日进行的第29届LG杯世界围棋棋王战决赛第三局中,中国棋手柯洁九段因提子未及时置于棋盒盖,在之后的棋局关键处、轮到对手卞相壹九段落子时被现场裁判中断比赛。中国围棋协会认为裁判中断时机不当,影响比赛正常进行,棋手受到裁判过度干扰,无法继续完成比赛。经向赛事主办方韩国棋院申诉,申请重赛无果,中国围棋协会不接受本届LG杯第三局结果。”
22日进行的次局比赛开局约半小时、棋局进行至第44手时,现场裁判判定柯洁违规,原因是柯洁在第18手提子后,未依照韩国棋院在2024年年底新修改的棋局规则将棋子放在棋盒盖中。中方提出异议称规则并未明确规定放置棋子的具体时间,韩方未同意,柯洁被罚两目。比赛在中断了约半个小时后继续,柯洁在第80手提子后又未将棋子放置在位于棋盘左侧的棋盒盖中,卞相壹应以81手,并在柯洁落下第82手后暂时离开座位倒水时举手向裁判投诉,柯洁迅速回到座位放置棋子但依然被裁判判定第二次违规,直接判负。中国代表团此后长时间申诉无果,大比分就此扳平。